自然流产孕囊多久流出来没有具体时限，需依据具体情况而定。自然流产后，部分女性会出现阴道不规则流血及下腹疼痛、腰酸等现象。如果流血量越来越多、腹痛加剧，孕囊在短时间内就会通过子宫的收缩排出体外。

但也有部分女性属于自然流产中的特殊类型，即过期流产。这种情况下孕妇可能不会出现阴道流血及腹痛的情况，而且孕囊无法自行排出，往往是在女性通过超声检查后发现孕囊已经停止生长才诊断出，需要通过药物或手术的方式将孕囊排出。

因此，孕囊的排出情况因人而异。