化脓性角膜炎的治疗要根据患者致病菌的类型，感染病灶的具体情况给予相应的药物治疗，或者其他治疗方案。

例如明显细菌因素引起的化脓性角膜炎，应及时给予抗生素类药物控制感染，例如青霉素、头孢、氧氟沙星等。后期可根据病理产物的检验结果调整用药，选择敏感性更高的抗生素。

如果患者为真菌或者病毒感染，可通过联合用药的方式抵抗真菌或者抗病毒药物治疗。并发有虹睫炎症状的患者要及时使用散瞳药，避免虹膜粘连或者继发性青光眼的发作。