脑多普勒超声又称经颅多普勒超声，并不是直接用来检测脑供血不足。但是它可以通过检查出脑血管闭塞或者狭窄来间接地提示存在着脑供血不足。

经颅多普勒彩超是检测颅内动脉的狭窄情况和监测脑血流中微栓子的重要方法。还用于检查脑动脉瘤、脑血管痉挛，对于评价蛛网膜下腔出血后是否有脑血管痉挛很有意义。

实时监测脑血流中的微血栓，对于急性脑梗死的诊断很有意义。脑多普勒超声还能帮助判断颅内压升高或者脑死亡。