对于卵巢一侧有囊肿的女性是否可以怀孕，这得根据囊肿的大小、性质以及女性的伴随症状来综合判断。

比如女性的卵巢一侧只是有普通的囊肿，而且囊肿小于三厘米，都可以正常备孕、怀孕。一般这种小囊肿都不会影响女性的生育功能，只是在怀孕以后要定期检查彩超看囊肿的大小变化情况。

如果女性是卵巢一侧有巧克力囊肿而且囊肿已经超过五厘米，还伴有严重的痛经症状，多建议要先行腹腔镜手术将其切除，然后再备孕、怀孕。