乙状结肠炎的发病原因尚未完全明确，本病的发生可能是多种因素共同作用的结果，如免疫因素、遗传因素、环境因素和感染因素。

结肠炎可能属于自身免疫性反应。结肠炎患者中大约有1/3来源亲属遗传，也有可能是与生活习惯和生活方式有关，不良的生活习惯导致肠道炎症。

本病的发生多属于肠道感染，其他有可能是生活特征与生活中的重大事件的心理承受能力适应性差，属于新生疾病的一类。乙状结肠炎的发病原因有待进一步研究。