多房棘球蚴病引发的原因主要是食用过含虫卵的生水或蔬菜而导致，这些虫在大多以野狗、狐、狼等为主要宿主，当体内带有泡球蚴的鼠类或动物脏器被野狗、狐、狼等终宿主吞食后，经过大概45天原头蚴可以发育为成虫，并排出孕节和虫卵。地甲虫可起转运虫卵的作用，鼠类亦可因捕食地甲虫而受感染。

人一旦误食，虫卵在小肠内孵六钩蚴，后者通过血运侵入肝脏，发育为泡球蚴。本病原发病位于肝脏，可通过血运等途径播散至肺、脑等器官，产生继发性或转移性病变。