新生儿乙型肝炎黄疸不会自行消退。

新生儿的黄疸有两种，一种是生理性黄疸，另一种是病理性黄疸。生理性黄疸能够通过照射蓝光或太阳光等能够自行消退，但是病理性黄疸如新生儿乙型肝炎黄疸或溶血性黄疸等不会自行消退。

新生儿乙型肝炎黄疸产生原因是肝细胞炎症、水肿导致压迫肝内胆管，使毛细胆管堵塞、胆管内的胆汁淤积从而反流入血液，形成高胆红素血症，也就形成黄疸，这类黄疸不能通过照射蓝光等治疗只能通过药物进行降酶、退黄治疗。所以，新生儿乙型肝炎黄疸不能自行消退。