克林霉素可以出现胃肠道的副作用，患者在使用克林霉素后可以出现腹痛、腹泻的症状，严重的患者可以发生水样便，部分患者可以出现发热症状。

有些患者对克林霉素的成分会发生过敏，使用此药后可以出现皮肤瘙痒的症状。同时可以伴有皮疹，少数患者使用克林霉素后可以出现头晕、头胀的症状。

大剂量使用克林霉素后会导致患者出现心血管系统的反应，患者可以表现为血压下降，有些患者会出现肝脏的损害，多数表现为转氨酶的升高。