星形病毒胃肠炎因为出现腹泻，营养吸收不良，再加上食欲差，营养素的摄入也减少了，这会造成各种营养素缺乏，慢性腹泻尤其严重，营养不良、营养性贫血和各种维生素缺乏症也很常见。

长期腹泻后，全身抵抗力低，还可能会继发各种感染，常见的有中耳炎、支气管炎、支气管肺炎、尿路感染、皮肤感染和败血症。

星形病毒胃肠炎的临床表现与轮状病毒性胃肠炎相似，药物治疗可先有效止泻，服用蒙脱石粉再联合抗病毒药物治疗。