肺部真菌感染通常需要完善胸部CT检查。通过胸部影像学检查发现是否有肺部真菌感染性病灶，并根据其影像学的改变和特点初步判断可能的真菌种类，患者需要早期完善真菌的相应病原学检查。

临床上常完善G试验、GM试验和乳胶凝集试验等，通过此些血检常可协助诊断真菌感染。特别是乳胶凝集试验是诊断肺隐球菌肺炎特异性检查依据。患者通常还需要完善痰培养痰、痰真菌涂片等，通过痰液检查可进一步地判断真菌感染的种类。

部分患者还需要通过支气管镜或经皮肺穿刺活检等手段来明确其病理诊断。当然患者还需要常规完善血常规、C反应蛋白、肝肾功能等相关检查。