肾结石可以堵塞在集合系统任何部位，均可引起肾盂积水，尿内细菌增多。尿内细菌含量达到一定程度，会导致严重的集合系统感染，可出现脓肾、感染性休克，危及生命。

肾结石长期引起泌尿系梗阻，肾盂积水持续增多，会导致肾实质压迫变薄，从而影响肾脏功能，严重者肾功能衰竭，导致无尿，并且长期的慢性梗阻、刺激可增加肿瘤的发生率，引起尿路上皮癌、肾脏恶性肿瘤。

并且泌尿系统梗阻后可出现腰部的疼痛不适、血尿、畏寒、发热、膀胱刺激症等症状。