包皮龟头炎可能是引起阴茎疼痛的原因之一。由于解剖位置邻近，其中任一部位的感染性疾病、炎性刺激，都有可能导致另一部位的不适疼痛感觉。

阴茎疼痛常见的其它原因，是过大外力挤压刺激导致的损伤性疼痛，常见的是性体位选择不当、性动作力度过大等。也有可能是阴茎硬结等，导致的疼痛。

结合阴茎疼痛发生时间、观察龟头外观性状，以及辅助浅表探头彩超检查，明确阴茎疼痛原因后针对性的治疗。有包皮龟头炎存在，需要及时抗生素消炎治疗。