第一，发病部位不同，耳疖子主要是位于外耳道、耳甲腔、耳廓表面皮肤，是由于皮肤感染造成的毛囊炎。脓耳主要是由于患者患有慢性中耳炎、急性中耳炎、耳膜穿孔、中耳腔里的脓性分泌物，经外耳道流出形成脓液，它的发病部位主要在中耳腔。

第二，治疗方法不同，耳疖主要是给予口服，或者是静脉输注抗炎药的同时，局部给予抗生素软膏涂抹于患处，并且可以给予理疗治疗。中耳炎的治疗除了口服，或者是静脉抗生素控制感染以外，还需要滴用双氧水清洗中耳腔，把中耳腔的脓性分泌物清理出来，同时再点入左氧氟沙星滴耳液，给予药物灌洗。

同时要保持中耳及外耳道通畅，减少分泌物的阻塞。