龟头糜烂需要给予抗生素治疗，可常规性给予头孢类或者是喹诺酮类药物抗炎治疗。

由于糜烂创面常由致病菌感染引起，在未得到及时有效抗炎治疗的情况下，而破坏龟头表面的完整性，从而有糜烂外观。由于糜烂面无伴随疼痛，还需要结合无保护的不洁性行为史，需要采血做梅毒、尖锐湿疣等相关性传播疾病相关项目检查，检查提示梅毒螺旋体导致的感染，可给予苄星青霉素进行治疗。

由于人乳头瘤病毒感染引起的龟头外观异常糜烂，局部给予激光烧灼，同时给予抗病毒药物治疗。