病毒性睾丸炎最常见的致病原是流行性腮腺炎病毒和柯萨奇B组病毒。

另外，流感病毒、感染性单核细胞增多症、淋巴性脉络丛脑膜炎、腺病毒、天花、水痘、牛痘、风疹、登革热、白蛉热病毒以及人类免疫缺陷病毒，偶尔也可导致急性睾丸炎。近年来一直有报道指出西尼罗病毒导致睾丸淋巴浸润也能发生睾丸炎。亚临床型睾丸炎可能发生于其他病毒性感染疾患，病毒可以经过血流达到睾丸，也可以随着尿液排出引起急性的睾丸炎。