根据典型的临床表现，如眼部刺激症状及睫状充血、角膜浸润浑浊或角膜溃疡形态，临床诊断通常不困难，但应强调病因诊断及早期诊断。详细询问病史十分重要。

外伤史往往容易被忽略，实际上角膜擦伤和异物是最常见的原因。角膜病既往史也非常重要，例如角膜单疱病毒性角膜炎，经常复发的病史，是诊断的主要依据之一。

患者的药物史也要明确，糖皮质激素的使用可使某些感染性疾病恶化。棘阿米巴性角膜炎有佩戴角膜接触镜史，真菌性角膜炎有植物性外伤史等等。