甲肝潜伏期可以查出来。

一般感染甲肝病毒后会有1~3个月不等的潜伏期，甚至有部分可长达半年的潜伏期。在潜伏期内，患者没有症状，如没有乏力、恶心等消化道症状，也没有黄疸。但实际上机体已经感染了甲肝病毒，只是处于潜伏期。但是机体感染甲肝病毒后，会出现甲肝抗体。而甲肝抗体一般在感染甲肝病毒后2周即可以出现，所以只要经过甲肝抗体的窗口期，就能够通过检测甲肝抗体来明确是否感染了甲肝。

即使是在甲肝潜伏期，甲肝抗体也可以阳性，所以甲肝潜伏期能通过检查甲肝抗体查出来。