感染支原体以后会引发呼吸道和肺部的急性炎症改变，常同时伴有咽炎、支气管炎和肺炎。感染支原体以后应早期使用适当抗菌药物，可以减轻症状以及缩短病程，临床上多选用大环内酯类抗生素，疗程一般为2到3周，对大环内酯类不敏感者可以选用呼吸喹诺酮类。

由于支原体没有细胞壁，所以对于头孢类和青霉素类没有效果。对于支原体感染引起的剧烈呛咳，可酌情采用镇咳药物，并同时应注意饮食宜清淡，避免辛辣刺激食物，多喝温开水。