新冠肺炎的晚期症状主要为严重呼吸困难及其导致的低氧血症和高碳酸血症，除此之外机体缺氧还会引起休克、全身多器官炎症损害等多种并发症。

新冠肺炎的晚期治疗包括对血氧饱和度等多种生命体征指标的监测；无创或有创的机械通气，必要时可能需要ECMO；充分的液体复苏和血管活性药物，维持微循环和水、电解质的平衡；出现肾衰的患者可能需要透析；并发细菌感染时需要使用抗生素。

新冠肺炎晚期治愈后，仍然可能存在未好转的肺间质纤维化、肺功能受损等后遗症。