宫颈糜烂发生的大部分原因是女性生殖道内感染性传播疾病病原体，包括淋病奈瑟菌、沙眼衣原体；也有的患者是因为女性生殖系统防御功能下降，内源性的病原体、细菌性阴道病病原体、生殖支原体等，趁机侵袭感染人体，引起宫颈炎症，导致宫颈发生糜烂样改变。

另外如果女性处于青春期、妊娠期、生育年龄时雌激素分泌比较旺盛，或者是口服紧急避孕药物，因为体内雌激素水平升高，可以使柱状上皮外移，导致子宫颈局部呈糜烂样改变外观。

但是这些并不是真正的宫颈糜烂，这是正常的生理性柱状上皮异位。如果女性患有子宫颈上皮内瘤变及早期宫颈癌，也可使子宫颈呈糜烂样改变。