功能性消化不良有可能会反复发作。如果患者长期处于焦虑、抑郁以及生活不规律并且熬夜时，功能性消化不良反复发作出现的几率可能更大。

假如患者经常暴饮暴食、饮食结构搭配不合理，有经常酗酒、抽烟等不良生活习惯时，也可能会导致上述疾病的反复发作。

为了预防上述疾病的反复发作，需要调整患者的饮食习惯、生活习惯，避免抽烟、喝酒，并且要保证良好的运动习惯，对于疾病的恢复及预防有促进作用。症状严重的患者需要及时地使用药物治疗，才能缓解症状。