肛门瘙痒的患者，如果是由于肛门局部皮肤发生过敏性的反应，可以口服抗过敏的药物，比如盐酸西替利嗪片。另外还可以口服抗组胺药物进行对症的治疗，比较常用的有扑尔敏、苯海拉明等药物。一些年老的患者或者是女性，可以适当使用性激素进行口服，具有良好的改善的作用。

肛门瘙痒如果是由于局部发生细菌的感染，可以考虑使用抗生素药物进行口服，比较常用的有头孢类的抗生素或者是红霉素、阿奇霉素等相关的抗生素。

患者肛门局部还可以适当涂抹药膏，进行对症的治疗，主要就是止痒、抗菌以及激素类的药膏为主。