目前，肝外胆管结石的手术主要包括传统的开腹手术和腹腔镜的微创手术。

随着科学技术的发展和医疗水平的进步，腹腔镜微创技术已经在临床实践中被广泛普及，对于肝外胆管结石而言，腹腔镜下胆管切开取石具有创伤小，恢复快，视野清晰的优点，虽然术中损伤胆道的风险相对较高，但是很多经验丰富的医生，能够很熟练的进行手术操作。

在对肝外胆管结石治疗的过程中，还出现了以ERCP等技术为基础的内镜下取石，即经口、咽、食道、胃、十二指肠进入胆管，进行取石操作，它的创伤更小。