无论是自然怀孕，还是试管婴儿移植，其实胚胎的质量都是有好坏的区别，并不是自然怀孕的胚胎一定会比试管婴儿的质量要好一些。

比如女性是因为双侧的输卵管堵塞而进行试管婴儿移植，这个时候胚胎的质量往往跟自然怀孕没有任何的差异，所以并不是自然怀孕的胚胎质量就一定比试管婴儿要好。

还有一些女性在自然怀孕的情况下，可能会因为精子的质量不佳或者是因为卵子质量异常导致胚胎质量的异常，而在做试管婴儿移植的时候，往往都是选择生长发育比较良好的囊胚进行移植的，所以这个时候试管的质量可能会比自然怀孕的质量要好一些的。