甲状旁腺功能减退症会有多种多样的并发症，最主要的有手足抽搐的表现，有的伴麻木感、虫爬感或肌肉疼痛。典型的抽搐患者有手足的僵硬、拇指内收、弯曲等。

有的患者可能会出现神经系统的表现，出现癫痫发作，伴有口角、四肢抽搐、支气管痉挛和哮喘。有的可能会出现皮肤干燥、皮肤粗糙、毛发脆弱或斑秃。

胃肠道方面病人可能会出现长期的便秘或者腹泻。先天性甲旁减的患者会有颅面部骨骼畸形、骨质硬化等。甲状旁腺功能减退症是甲状旁腺激素分泌减少或不足引起的临床症候群。