三叉神经痛容易与以下几种疾病混淆：

1.一侧的牙痛，牙痛严重时会导致三叉神经部位疼痛，但是，牙痛是持续性的胀痛或者隐痛，做检查时会发现牙龈红肿。

2.三叉神经炎，三叉神经炎一般是由于代谢疾病累及导致，发病时会造成三叉神经分布区持续性的疼痛，通常与代谢疾病同时存在。

3.舌咽神经痛，这种疼痛位置主要分布在舌根、扁桃体、咽部，如果症状严重会累及到三叉神经部位。

4.蝶腭神经痛，这种疼痛是面深部的疼痛，主要放射到眼眶深部、鼻根、耳根等部位。