耳后根神经抽痛，可能为精神因素所引起，常见于长期存在较大的心理压力、精神过度紧张的人。由于精神长期处于紧张的状态，得不到有效放松，很可能会导致头部及耳后根神经过度紧张，久而久之就容易引起耳后根神经抽痛，还可伴有头痛症状。

也可能是耳大神经痛所致。耳后根部位分布有耳大神经、枕小神经以及迷走神经等一些神经的分支，当神经主干或神经末梢受到某些病变侵犯时，便可引起分布在耳后根部位的神经抽痛，常被病人自述为耳后根神经抽痛。

另外，还可能为带状疱疹病毒感染所致，当带状疱疹病毒对大脑造成侵犯时，可引起耳后根神经抽痛。