川崎病吃阿司匹林最常见的副作用为胃肠道反应，阿司匹林刺激胃黏膜可以引起恶心、呕吐、上腹部不舒服或疼痛，停药后症状可自行消失。

少部分的患儿可出现过敏反应，表现为喘息、荨麻疹、血管神经性水肿，严重时可导致过敏性休克。过敏现象一般在服药后会迅速出现，已经在医生监护下服用过一段时间后，不要因为担心出现严重过敏反应，而自行停药。

少数服用阿司匹林的孩子还会有耳鸣、听力下降、肝肾功能损害现象，这些情况大多是可以自行恢复的。