肛瘘是肛周脓肿的后遗症，是因肛内肛窦受到损伤，发生了感染，炎症沿着肛腺导管逐渐向肛门直肠周围的软组织内蔓延扩散，从而形成肛周脓肿，肛周脓肿破溃后或经切开放脓后，脓腔缩窄呈管状，外口可愈合成乳突状，这时就形成了肛瘘。

肛瘘的临床表现是肛门周围的皮肤上有一个外口，会反复的淋漓不断的自外口处流出脓血样物或粪便。

而肠子溃烂一般是指溃疡性肠炎，溃疡性肠炎的临床表现一般是大便次数增多，排便时会出现粘液血便，有的会伴有腹痛等症状。

这两种疾病的临床表现截然不同。所以肛瘘并不是肠子溃烂了。