麻醉肠镜的过程中，是不会有疼痛感的。因为在进行麻醉肠镜时，要先使用静脉麻醉药物滴注，患者很快就会入睡，然后，在入睡的过程中，进行肠镜检查。

肠镜检查的过程中，进镜时可能会有腹痛、腹胀的感觉，但患者因进入深度睡眠，所以不会感觉到不适感。这种检查结束后，患者很快就会清醒，而且没有任何不适的后遗症。

因为麻醉肠镜没有疼痛感，这种检查方式非常受患者的欢迎。临床上，患者经常要求进行麻醉肠镜，只要身体条件允许都可以进行。