拔完牙第二天嗓子疼有以下原因：

1.拔牙本身就是一种手术操作，会导致局部黏膜暴露，会导致局部炎症扩散加重。由于嗓子比如咽喉部黏膜或者扁桃体与牙齿位置很近，炎症可以累及扁桃体，甚至是咽后壁等相关的结构，可以导致局部出现炎症反应，患者可以出现嗓子疼的可能。

2.拔牙的时候，如果有局部组织的损伤，比如误伤了扁桃体或者前后弓的时候，可以导致局部出现炎症反应，也可以出现疼痛的可能。

拔完牙之后嗓子疼，应用抗生素治疗都是可以有效地控制好，患者也不必太过于紧张，可以上口腔科找手术医生复查一下，也可以上耳鼻喉科找医生检查咽喉部以及扁桃体的情况，然后进行对症处理。