阴茎根部长红点、瘙痒，考虑是毛囊炎、皮肤过敏、真菌感染等因素引起的。

阴茎根部有较多的毛囊，毛囊会分泌一些分泌物，当毛囊的出口发生堵塞时，分泌物无法排出，受到细菌感染后，引起出现红色的小疙瘩凸起，伴有发痒、疼痛。也有可能是皮肤过敏引起的，大多是因为接触了过敏的物质或者服用过敏的药物，进食某些过敏的食物后引起的，做过敏原检测就可以确诊，需给予抗过敏的药物治疗。

阴茎受到真菌感染，也可引起瘙痒，通常见于糖尿病、长时间服用抗菌素的患者。需要前往医院完善相关的检查，确诊病因，再给予止痒对症治疗。