肛窦炎和痔疮是有区别的。

首先，这两者的发病原因不同。肛窦炎大多是因为粪便滞留在肛隐窝，无法清洁，从而引起细菌感染，导致炎症的发生；痔疮是痔区静脉回流受阻，血管淤积形成的血管团，不是细菌感染引起的。

其次，症状也不同。肛窦炎主要表现为肛门坠胀、疼痛、排便不尽感，疼痛感可放射到腹部；痔疮主要表现为便血、肛门肿物脱出、肛门下坠、瘙痒等症状。

此外，治疗方法也不同。肛窦炎需要用抗生素抗感染治疗和局部坐浴、肛门内塞痔疮栓等治疗；痔疮通常不需要用抗感染的药物，一般用痔疮栓、痔疮膏和坐浴治疗。