肛瘘术后渗液干净的时间不等。低位肛瘘术后渗液一般两周左右能干净，高位肛瘘术后渗液三至四周或四周以上能干净。

低位肛瘘创面浅，渗液少，渗液消失、创面愈合时间短。高位肛瘘创面深，渗液多，渗液消失、创面愈合时间长。

肛瘘手术需要切除内口，切开瘘管，创面不缝合。开放创面是为了引流通畅，有利于创面炎性、脓性分泌物溢出，待创面出现新鲜肉芽组织，渗液减少消失后，创面会逐渐愈合。