胃肠功能紊乱是不会影响月经。

胃肠功能紊乱患者主要由于胃肠动力不足，从而导致食欲下降、恶心、呕吐、引起胃部胀气，并可伴有腹泻或者便秘的症状，主要是以消化道症状为主不会影响月经。导致女性月经出现异常与体内的激素、女性妇科疾病，比如子宫肌瘤、子宫腺肌症、环境的突然改变等这些因素有关系，从而导致月经推迟、月经提前、月经量多或月经稀发等。

胃肠功能紊乱患者伴有月经异常，需治疗胃肠功能紊乱的基础上到妇科确诊病因治疗，才能促进月经恢复正常。