肛门两边摩擦疼应该属于肛周皮肤的疾病，常见的有肛周炎。对于一些长期坐着、臀沟较深的人群，肛门周围汗腺分泌过于旺盛，会导致局部的环境潮湿，就有可能引发局部细菌感染而导致肛周炎，表现为肛周皮肤发红并且伴有疼痛症状，特别是行走时，两侧臀部皮肤的摩擦会加重疼痛。

患者可以外用皮炎平软膏或者曲安奈德益康唑软膏控制症状，大多使用2~3天症状就会消失。平时患者需要注意肛门局部清洁卫生，并保持肛门部干燥，避免久坐。

另外，也有可能是肛周湿疹或者肛周皲裂等肛周皮肤疾病。患者需要去医院就诊，明确诊断后，再采取相应的治疗。