霉菌性阴道炎主要的致病菌是白色念珠菌，白色念珠菌作为条件致病菌，10%到20%的非孕妇女及30%的孕妇，阴道中有此菌的寄生，但菌量极少，并不引起症状。只有在全身及阴道局部微生态环境改变，或细胞免疫力下降时念珠菌大量繁殖，并转变为菌丝相才出现症状。

妊娠时机体免疫力下降，性激素水平升高，阴道内上皮糖原增加，酸度增高有利于念珠菌的生长，及假菌是的形成。在治疗上无症状者不需要治疗，妊娠期霉菌性阴道炎以阴道用药为主，可以选用硝酸咪康唑、克霉唑和制霉菌素等。

妊娠期霉菌性阴道炎治疗的效果不如非妊娠期的治疗，对于反复发作的应在分娩前积极用药治疗，一方面可改善阴道炎症情况，以避免分娩时的裂伤。另一方面可减少或避免新生儿真菌感染。