矮小症的初步诊断可以通过骨龄的检查进行初步诊断，通过骨龄与实际身高做对比，诊断为矮小症。

如果涉及矮小症的进一步病因的诊断，以及涉及矮小症治疗时，核磁检查是必须做的。人体分泌生长激素的器官在头部的垂体，垂体核磁是一定要做，排除垂体先天的一些病变，比如生殖细胞瘤等等。所以在涉及到病因诊断，以及涉及到矮小症治疗时，头部垂体核磁是一定要做的。

如果家长并不需要进行矮小症的病因诊断，以及需要根据孩子矮小的情况采取生长激素治疗等一些措施时，可以不做核磁。