儿童患甲亢的病因和成人类似，甲亢是由于甲状腺腺体分泌过多的甲状腺激素引起，而造成甲亢的病因通常是一些甲状腺相关的疾病。其中最为常见的是弥漫性毒性甲状腺肿，该病会造成甲状腺腺体增生，进而导致甲状腺激素分泌过多。

其次，还有桥本氏甲状腺炎，由于自身甲状腺抗体存在，早期会造成甲状腺腺体的破坏，甲状腺激素过多的释放入血，出现一过性甲亢，随着甲状腺组织进一步破坏，会出现甲减的状态。

另外，当摄入的碘过多时，会使甲状腺激素合成增多，出现甲亢的情况。