巩膜炎可以并发玻璃体浑浊或脉络膜炎、视乳头水肿，甚至渗出性视网膜脱离。巩膜炎消退后，可有广泛的脉络膜视网膜萎缩。反复发作可以导致巩膜软化穿孔，甚至葡萄肿，葡萄膜炎、角膜炎、白内障、因房角黏连可以形成继发性青光眼。另有一种炎性征象不明显的坏死性巩膜炎，巩膜进行性变薄、软化和坏死，轻微外伤或眼内压增高即导致巩膜穿孔，多数病人伴有长期的风湿性关节炎。