特异性尿道炎和非特异性尿道炎的区别主要在致病菌不同、感染途径不同。

特异性尿道炎通常是由于淋球菌、支原体、衣原体等细菌感染，而非特异性尿道炎是由于大肠杆菌、变形杆菌、链球菌、金黄色葡萄球菌感染。

特异性尿道炎尿道炎主要通过不洁性交传染，属于性传播疾病，具有一定的传染性。而非特异性尿道炎感染途径为上行感染。两者由于致病菌不同，在治疗时使用药物也不同。