孕妇做核磁共振检查的危害，由于目前研究还不够深入，所以它对胎儿产生的不良影响一直存在争议的，目前主要的观点认为：

三个月以内的孕妇是不能够做核磁共振检查。主要是因为胎儿发育的头三个月以内是一段非常敏感的时期，如果检查时所使用的磁场强度比较强，有可能会对发育中的胎儿产生生物效应，并且干扰细胞的正常分化。

而怀孕三个月以后的孕妇，是否需要做核磁共振检查，要根据患者的具体情况来决定。如果超声能够满足疾病诊断的需要，那么就不需要做核磁共振检查。

如果超声等其他的影像学检查无法判断，必须要用核磁共振来判断，可以权衡利弊考虑核磁共振检查，但是一定要避免患者接受高磁场的环境。