尿尿的时候疼，最为常见的原因可能为尿路感染，比如急性膀胱炎、急性尿道炎等。由于病人的尿路系统受到炎症的刺激作用，导致局部黏膜破溃，就会在排尿时对破溃的黏膜形成刺激，引起排尿疼痛，还可伴有尿频、尿急等表现。

也可能为尿路结石所致，常见于尿道结石、膀胱结石等，都容易对周围的组织形成损伤，进而在排尿时对损伤部位造成刺激引起。另外，还可能为生殖器疱疹、梅毒、淋病等性传播疾病所引起。

因此，在出现排尿疼痛症状时，千万不要耽搁时间，应第一时间到医院就诊，明确诊断后针对原发病进行治疗，防止延误病情。