半边喉咙连着耳朵深处疼，可能有以下情况：

1.有可能与扁桃体周围脓肿、咽旁脓肿等比较严重的炎症性感染性疾病有关系。上述疾病发病的位置比较深，局部感染累及的范围比较大，可以导致患者出现耳部的放射性疼痛。也可以直接诱发患者出现中耳炎、鼓膜炎等相关疾病，都可以出现耳朵的疼痛感。

2.有可能与扁桃体恶性肿瘤、喉癌、下咽癌、肿物局部破溃有关系。肿瘤局部破溃之后，会导致非常明确的疼痛感。这种疼痛感药物治疗没效，会通过神经放射牵涉到耳朵。