新生儿艾滋病临床表现为10~12个月，潜伏期有长有短，长的可以达到15年左右，短的可能几个月就发病了。其中大部分，大约是80%以上在3岁以前会出现症状；在我国，平均发病年龄是8~9岁左右。

新生儿艾滋病主要是通过母婴垂直传播感染的，典型的临床表现，包括急性感染期、潜伏期、晚期、艾滋病期，大多数感染在出生时临床和免疫学显示是正常的，少数会出现肝脾肿大和淋巴结病等。

有可能会出现低出生体重或者是各种先天畸形，比如小头畸形、鼻梁塌陷、眼距增宽、眼裂缩小等多种问题。