引起感染性直肠炎的因素有很多，可能跟不卫生的饮食习惯或者吃了变质的食物有关，从而引起沙门菌或者志贺菌感染直肠，导致的感染性直肠炎。

也可能是由于肛门清洁卫生工作差，导致肛周皮肤被细菌感染而引起；还可能是由于直肠受到外伤后所致的直肠细菌感染。此外，一小部分患者会因为存在不洁的性交史，尤其是肛交史也会所致感染性直肠炎。

感染性直肠炎是由于肠道被细菌、病毒或者其它病原体微生物感染后所致，因此为了防止该病的发生，需要尽可能的避免这些因素。