胸腔镜手术可以用于先天性心脏病的。不过这种手术方式仅仅限于相对比较简单的先天性心脏病，比如单纯房间隔缺损、单纯室间隔缺损、主动脉窦瘤等等。胸腔镜手术治疗先天性心脏病相对来说创伤小，手术时间短，给病人造成的痛苦也小。

对于较复杂的先天性心脏病还是需要做直视手术的，现在还有一种治疗方式就是可以通过介入的方式治疗。先天性心脏病不管采取哪一种治疗方式，都应该严格掌握适应症，评估患者术前术后可能的情况以及预后。