脖子两侧长小疙瘩可能是以下原因所导致：

1.蚊虫叮咬。在蚊虫叮咬后，会导致局部皮肤起小疙瘩，可以去医院的皮肤科进行明确。如果为该问题，可以涂抹一些药物，包括碘伏溶液等，症状可逐渐缓解。

2.有可能是过敏所引起。例如吃不恰当的食物，常见的有海鲜。有时也是由于接触一些植物，例如蒿草或者是动物毛发所引起，也需要尽早去医院的皮肤科进行明确。如果为该问题，需要积极脱离过敏原，部分患者可能需要服用脱敏药物进行治疗，例如苯海拉明、西替利嗪等。

3.有可能是毛囊感染所引起。需要外涂一些药物，例如碘伏溶液或者是莫匹罗星软膏等进行治疗。少部分患者可能需要服用抗生素，例如头孢呋辛、头孢氨苄等。