正常情况，如果女性平时月经周期比较规律，每个月是28~30天一次，怀孕40天做子宫B超检查，一般可以看到宫腔有孕囊。

如果女性平时月经周期不规律，有可能会出现排卵提前或推后等情况。所以根据末次月经时间计算的怀孕40天，时间不是太准确，有可能实际怀孕不到40天。如果实际怀孕时间比较短，在怀孕40天时候做B超检查，有可能在宫腔看不到孕囊。

需要推迟一周左右，做一次B超复查，确诊宫腔是否有孕囊，排除宫外孕等情况。怀孕40天B超检查，宫腔看不到孕囊，也可以配合医生抽血检查血HCG值，确诊是否有宫外孕。