肌肉萎缩症不能治愈。肌肉营养不良，由于没有特异性治疗，病情逐渐发展，大部分预后不好。

患肌营养不良症的人要到12岁才能走路，大多数患者在20多岁时死于呼吸衰竭或心力衰竭。眼咽部、眼部和远端肌营养不良患者的预后较好，部分患者可以接近正常生活。

然而由于肌肉萎缩症无法治愈，也没有有效的治疗方法，因此发现肌肉萎缩症尤其重要携带者，进行产前诊断并中止患病的胎儿。产前诊断需要在条件较好的医院进行。